University of Turin logo DBIOS logo


Status of SARS-CoV-2 detection systems (RT-PCR)
enabled by data from GISAID logo


Update: Sun Oct 25 07:18:47 2020 (UTC+2)

Author: Olivier Friard - Department of Life Sciences and Systems Biology - University of Turin - Italy

We gratefully acknowledge the Authors of the Originating and Submitting laboratories of the genetic sequence and metadata shared via GISAID, on which this research is based.
The isolates collection dates are in YYYY-MM-DD format (ISO 8601).

Go to home

Japan

Number of isolates sequences available: 806

Method

When the target sequence of amplification systems is available the primers and probe are aligned against the target sequence using the Smith-Waterman local sequence alignment algorithm and the alignments are classified in 3 categories:
             Full match - All primers and probe have a 100% identity with the target sequence. In case of a 2 probes system (RdRP) at least one probe must have a 100% identity.
             The identities of forward/reverse primers AND probe are greater than or equal to 80% AND the length of the amplification product is comprised between the reference length plus/minus 8 bp.
             The identity of one primer OR the probe are less than 80% OR the length of the amplification product is NOT comprised between reference length plus/minus 8 bp.

If the target sequence is not available the The sequence is not available warning is shown.
Please note that the reverse primer sequence is shown reverted-complemented in the alignments.

Results

Move the mouse cursor over elements to see the details.

Virus name / Accession IDRegionCollection date2019-nCoV_N12019-nCoV_N22019-nCoV_N3E-SarbecoRdRP
Japan/Hu_DP_Kng_19-020/2020 EPI_ISL_4129682020-02-10
Japan/Hu_DP_Kng_19-027/2020 EPI_ISL_4129692020-02-10
Japan/TKYE6182/2020 EPI_ISL_4145112020-01
Japan/DP0005/2020 EPI_ISL_4165652020-02-15
Japan/DP0027/2020 EPI_ISL_4165662020-02-15
Japan/DP0037/2020 EPI_ISL_4165672020-02-15
Japan/DP0058/2020 EPI_ISL_4165682020-02-15
Japan/DP0059/2020 EPI_ISL_4165692020-02-15
Japan/DP0065/2020 EPI_ISL_4165702020-02-15
Japan/DP0077/2020 EPI_ISL_4165712020-02-15
Japan/DP0078/2020 EPI_ISL_4165722020-02-15
Japan/DP0104/2020 EPI_ISL_4165732020-02-15
Japan/DP0107/2020 EPI_ISL_4165742020-02-15
Japan/DP0121/2020 EPI_ISL_4165752020-02-15
Japan/DP0133/2020 EPI_ISL_4165762020-02-15
Japan/DP0134/2020 EPI_ISL_4165772020-02-15
Japan/DP0152/2020 EPI_ISL_4165782020-02-15
Japan/DP0158/2020 EPI_ISL_4165792020-02-15
Japan/DP0184/2020 EPI_ISL_4165802020-02-15
Japan/DP0190/2020 EPI_ISL_4165812020-02-15
Japan/DP0191/2020 EPI_ISL_4165822020-02-15
Japan/DP0196/2020 EPI_ISL_4165832020-02-15
Japan/DP0200/2020 EPI_ISL_4165842020-02-15
Japan/DP0236/2020 EPI_ISL_4165852020-02-16
Japan/DP0274/2020 EPI_ISL_4165862020-02-16
Japan/DP0278/2020 EPI_ISL_4165872020-02-16
Japan/DP0286/2020 EPI_ISL_4165882020-02-16
Japan/DP0287/2020 EPI_ISL_4165892020-02-16
Japan/DP0289/2020 EPI_ISL_4165902020-02-16
Japan/DP0290/2020 EPI_ISL_4165912020-02-16
Japan/DP0294/2020 EPI_ISL_4165922020-02-16
Japan/DP0311/2020 EPI_ISL_4165932020-02-16
Japan/DP0319/2020 EPI_ISL_4165942020-02-16
Japan/DP0328/2020 EPI_ISL_4165952020-02-16
Japan/DP0344/2020 EPI_ISL_4165962020-02-16
Japan/DP0346/2020 EPI_ISL_4165972020-02-16
Japan/DP0357/2020 EPI_ISL_4165982020-02-16
Japan/DP0361/2020 EPI_ISL_4165992020-02-16
Japan/DP0438/2020 EPI_ISL_4166002020-02-16
Japan/DP0457/2020 EPI_ISL_4166012020-02-16
Japan/DP0462/2020 EPI_ISL_4166022020-02-16
Japan/DP0464/2020 EPI_ISL_4166032020-02-16
Japan/DP0476/2020 EPI_ISL_4166042020-02-16
Japan/DP0481/2020 EPI_ISL_4166052020-02-16
Japan/DP0482/2020 EPI_ISL_4166062020-02-16
Japan/DP0543/2020 EPI_ISL_4166072020-02-17
Japan/DP0544/2020 EPI_ISL_4166082020-02-17
Japan/DP0568/2020 EPI_ISL_4166092020-02-17
Japan/DP0588/2020 EPI_ISL_4166102020-02-17
Japan/DP0644/2020 EPI_ISL_4166112020-02-17
Japan/DP0645/2020 EPI_ISL_4166122020-02-17
Japan/DP0654/2020 EPI_ISL_4166132020-02-17
Japan/DP0687/2020 EPI_ISL_4166142020-02-17
Japan/DP0690/2020 EPI_ISL_4166152020-02-17
Japan/DP0697/2020 EPI_ISL_4166162020-02-17
Japan/DP0699/2020 EPI_ISL_4166172020-02-17
Japan/DP0700/2020 EPI_ISL_4166182020-02-17
Japan/DP0703/2020 EPI_ISL_4166192020-02-17
Japan/DP0724/2020 EPI_ISL_4166202020-02-17
Japan/DP0743/2020 EPI_ISL_4166212020-02-17
Japan/DP0752/2020 EPI_ISL_4166222020-02-17
Japan/DP0763/2020 EPI_ISL_4166232020-02-17
Japan/DP0764/2020 EPI_ISL_4166242020-02-17
Japan/DP0765/2020 EPI_ISL_4166252020-02-17
Japan/DP0779/2020 EPI_ISL_4166262020-02-17
Japan/DP0785/2020 EPI_ISL_4166272020-02-17
Japan/DP0786/2020 EPI_ISL_4166282020-02-17
Japan/DP0802/2020 EPI_ISL_4166292020-02-17
Japan/DP0803/2020 EPI_ISL_4166302020-02-17
Japan/DP0804/2020 EPI_ISL_4166312020-02-17
Japan/DP0827/2020 EPI_ISL_4166322020-02-17
Japan/DP0880/2020 EPI_ISL_4166332020-02-17
Japan/DP0890/2020 EPI_ISL_4166342020-02-17
Japan/Hu_DP_Kng_19-031/2020 EPI_ISL_4208892020-02-14
Japan/Hu_Kng_19-437/2020 EPI_ISL_4208902020-03-09
EPI_ISL_434561
EPI_ISL_434562
EPI_ISL_445183
EPI_ISL_454749
EPI_ISL_462439
EPI_ISL_462440
EPI_ISL_462441
EPI_ISL_462442
EPI_ISL_462443
EPI_ISL_462444
EPI_ISL_462445
EPI_ISL_468724
EPI_ISL_468725
EPI_ISL_479676
EPI_ISL_479677
EPI_ISL_479678
EPI_ISL_479679
EPI_ISL_479680
EPI_ISL_479681
EPI_ISL_479682
EPI_ISL_479683
EPI_ISL_479684
EPI_ISL_479685
EPI_ISL_529135
EPI_ISL_591347
EPI_ISL_591348
EPI_ISL_591349
EPI_ISL_591350
EPI_ISL_591351
EPI_ISL_591352
EPI_ISL_591353
EPI_ISL_591354
EPI_ISL_591355
EPI_ISL_591356
EPI_ISL_591357
EPI_ISL_591358
EPI_ISL_591359
EPI_ISL_591360
EPI_ISL_591361
EPI_ISL_591362
EPI_ISL_591363
EPI_ISL_591364
EPI_ISL_591365
EPI_ISL_591366
EPI_ISL_591367
EPI_ISL_591368
EPI_ISL_591369
EPI_ISL_591370
EPI_ISL_591371
EPI_ISL_591372
EPI_ISL_591373
EPI_ISL_591374
EPI_ISL_591375
EPI_ISL_591376
EPI_ISL_591377
EPI_ISL_591378
EPI_ISL_591379
EPI_ISL_591380
EPI_ISL_591381
EPI_ISL_591382
EPI_ISL_591383
EPI_ISL_591384
EPI_ISL_591385
EPI_ISL_591386
EPI_ISL_591387
EPI_ISL_591388
EPI_ISL_591389
EPI_ISL_591390
EPI_ISL_591391
EPI_ISL_591392
EPI_ISL_591393
EPI_ISL_591394
EPI_ISL_591395
EPI_ISL_591396
EPI_ISL_591397
EPI_ISL_591398
EPI_ISL_591399
EPI_ISL_591400
EPI_ISL_591401
EPI_ISL_591402
EPI_ISL_591403
EPI_ISL_591404
EPI_ISL_591405
EPI_ISL_591406
EPI_ISL_591407
EPI_ISL_591408
EPI_ISL_591409
EPI_ISL_591410
EPI_ISL_591411
EPI_ISL_591412
EPI_ISL_591413
EPI_ISL_591414
EPI_ISL_591415
EPI_ISL_591416
EPI_ISL_591417
EPI_ISL_591418
EPI_ISL_591419
EPI_ISL_591420
EPI_ISL_591421
EPI_ISL_591422
EPI_ISL_591423
EPI_ISL_591424
EPI_ISL_591425
EPI_ISL_591426
EPI_ISL_591427
EPI_ISL_591428
EPI_ISL_591429
EPI_ISL_591430
EPI_ISL_591431
EPI_ISL_591432
EPI_ISL_591433
EPI_ISL_591434
EPI_ISL_591435
EPI_ISL_591436
EPI_ISL_591437
EPI_ISL_591438
EPI_ISL_591439
EPI_ISL_591440
EPI_ISL_591441
EPI_ISL_591442
EPI_ISL_591443
EPI_ISL_591444
EPI_ISL_591445
EPI_ISL_591446
EPI_ISL_591447
EPI_ISL_591448
EPI_ISL_591449
EPI_ISL_591450
EPI_ISL_591451
EPI_ISL_591452
EPI_ISL_591453
EPI_ISL_591454
EPI_ISL_591455
EPI_ISL_591456
EPI_ISL_591457
EPI_ISL_591458
EPI_ISL_591459
EPI_ISL_591460
EPI_ISL_591461
EPI_ISL_591462
EPI_ISL_591463
EPI_ISL_591464
EPI_ISL_591465
EPI_ISL_591466
EPI_ISL_591467
EPI_ISL_591468
EPI_ISL_591469
EPI_ISL_591470
EPI_ISL_591471
EPI_ISL_591472
EPI_ISL_591473
EPI_ISL_591474
EPI_ISL_591475
EPI_ISL_591476
EPI_ISL_591477
EPI_ISL_591478
EPI_ISL_591479
EPI_ISL_591480
EPI_ISL_591481
EPI_ISL_591482
EPI_ISL_591483
EPI_ISL_591535
EPI_ISL_591536
EPI_ISL_591537
EPI_ISL_591538
EPI_ISL_591539
Japan/AI-I-004/2020 EPI_ISL_407084Aichi2020-01-25
EPI_ISL_568556Aichi
EPI_ISL_568557Aichi
EPI_ISL_568558Aichi
EPI_ISL_568559Aichi
EPI_ISL_568560Aichi
EPI_ISL_568561Aichi
EPI_ISL_568562Aichi
EPI_ISL_568563Aichi
EPI_ISL_568564Aichi
EPI_ISL_568565Aichi
EPI_ISL_568566Aichi
EPI_ISL_568567Aichi
EPI_ISL_568568Aichi
EPI_ISL_568569Aichi
EPI_ISL_568570Aichi
EPI_ISL_568571Aichi
EPI_ISL_568572Aichi
EPI_ISL_568573Aichi
EPI_ISL_568574Aichi
EPI_ISL_568575Aichi
EPI_ISL_568576Aichi
Japan/P2-1/2020 EPI_ISL_419297Chiba2020-03-10
Japan/P2-2/2020 EPI_ISL_419298Chiba2020-03-10
Japan/P5-1/2020 EPI_ISL_419309Chiba2020-03-12
Japan/P5-2/2020 EPI_ISL_419310Chiba2020-03-13
Japan/P5-3/2020 EPI_ISL_419311Chiba2020-03-13
EPI_ISL_480042Chubu
EPI_ISL_480043Chubu
EPI_ISL_480044Chubu
EPI_ISL_480045Chubu
EPI_ISL_480046Chubu
EPI_ISL_480047Chubu
EPI_ISL_480048Chubu
EPI_ISL_480049Chubu
EPI_ISL_480050Chubu
EPI_ISL_480051Chubu
EPI_ISL_480052Chubu
EPI_ISL_480053Chubu
EPI_ISL_480054Chubu
EPI_ISL_480055Chubu
EPI_ISL_480056Chubu
EPI_ISL_480057Chubu
EPI_ISL_480058Chubu
EPI_ISL_480059Chubu
EPI_ISL_480060Chubu
EPI_ISL_480061Chubu
EPI_ISL_480062Chubu
EPI_ISL_480063Chubu
EPI_ISL_480064Chubu
EPI_ISL_480083Chubu
EPI_ISL_480084Chubu
EPI_ISL_480085Chubu
EPI_ISL_480086Chubu
EPI_ISL_480087Chubu
EPI_ISL_480088Chubu
EPI_ISL_480089Chubu
EPI_ISL_479823Chushikoku
EPI_ISL_480178Chushikoku
EPI_ISL_480179Chushikoku
EPI_ISL_479792Hokkaido
EPI_ISL_479793Hokkaido
EPI_ISL_479794Hokkaido
EPI_ISL_479795Hokkaido
EPI_ISL_479799Hokkaido
EPI_ISL_479800Hokkaido
EPI_ISL_479801Hokkaido
EPI_ISL_479812Hokkaido
EPI_ISL_479813Hokkaido
EPI_ISL_479814Hokkaido
EPI_ISL_479815Hokkaido
EPI_ISL_479816Hokkaido
EPI_ISL_479817Hokkaido
EPI_ISL_479818Hokkaido
EPI_ISL_479819Hokkaido
EPI_ISL_479820Hokkaido
EPI_ISL_479826Hokkaido
EPI_ISL_479827Hokkaido
EPI_ISL_479828Hokkaido
EPI_ISL_479829Hokkaido
EPI_ISL_479830Hokkaido
EPI_ISL_479831Hokkaido
EPI_ISL_479832Hokkaido
EPI_ISL_479833Hokkaido
EPI_ISL_479834Hokkaido
EPI_ISL_479835Hokkaido
EPI_ISL_479836Hokkaido
EPI_ISL_479837Hokkaido
EPI_ISL_479838Hokkaido
EPI_ISL_479839Hokkaido
EPI_ISL_479840Hokkaido
EPI_ISL_479841Hokkaido
EPI_ISL_479842Hokkaido
EPI_ISL_479843Hokkaido
EPI_ISL_479844Hokkaido
EPI_ISL_479845Hokkaido
EPI_ISL_479846Hokkaido
EPI_ISL_479847Hokkaido
EPI_ISL_479848Hokkaido
EPI_ISL_479849Hokkaido
EPI_ISL_479872Hokkaido
EPI_ISL_479873Hokkaido
EPI_ISL_479874Hokkaido
EPI_ISL_479875Hokkaido
EPI_ISL_479876Hokkaido
EPI_ISL_479877Hokkaido
EPI_ISL_479878Hokkaido
EPI_ISL_479879Hokkaido
EPI_ISL_479880Hokkaido
EPI_ISL_479881Hokkaido
EPI_ISL_479882Hokkaido
EPI_ISL_479883Hokkaido
EPI_ISL_479884Hokkaido
EPI_ISL_479885Hokkaido
EPI_ISL_479796HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479967HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479968HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479969HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479970HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479971HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479972HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479973HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479974HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479975HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479976HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479977HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479978HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479997HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479998HokurikuShinsyu
EPI_ISL_479999HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480000HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480001HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480120HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480121HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480122HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480123HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480124HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480125HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480126HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480127HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480128HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480129HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480130HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480131HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480132HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480133HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480134HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480135HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480136HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480137HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480138HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480139HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480140HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480141HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480142HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480143HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480144HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480145HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480146HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480147HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480148HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480149HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480150HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480151HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480152HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480153HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480154HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480155HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480156HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480157HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480158HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480159HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480160HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480161HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480162HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480163HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480164HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480165HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480166HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480167HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480168HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480196HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480197HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480198HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480199HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480200HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480201HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480202HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480203HokurikuShinsyu
EPI_ISL_480225HokurikuShinsyu
Japan/P3-1/2020 EPI_ISL_419299Ishikawa2020-03-09
Japan/P3-2/2020 EPI_ISL_419300Ishikawa2020-03-20
EPI_ISL_402126KanagawaThe sequence is not availableThe sequence is not availableThe sequence is not availableThe sequence is not availableThe sequence is not available
EPI_ISL_510545Kanagawa
EPI_ISL_479821Kansai
EPI_ISL_479822Kansai
EPI_ISL_479855Kansai
EPI_ISL_479856Kansai
EPI_ISL_479857Kansai
EPI_ISL_479858Kansai
EPI_ISL_479859Kansai
EPI_ISL_479860Kansai
EPI_ISL_479861Kansai
EPI_ISL_479862Kansai
EPI_ISL_479863Kansai
EPI_ISL_479864Kansai
EPI_ISL_479865Kansai
EPI_ISL_479866Kansai
EPI_ISL_479867Kansai
EPI_ISL_479868Kansai
EPI_ISL_479903Kansai
EPI_ISL_479904Kansai
EPI_ISL_479905Kansai
EPI_ISL_479906Kansai
EPI_ISL_479907Kansai
EPI_ISL_479908Kansai
EPI_ISL_479909Kansai
EPI_ISL_479910Kansai
EPI_ISL_479911Kansai
EPI_ISL_479912Kansai
EPI_ISL_479925Kansai
EPI_ISL_479926Kansai
EPI_ISL_479927Kansai
EPI_ISL_479944Kansai
EPI_ISL_479945Kansai
EPI_ISL_479946Kansai
EPI_ISL_479947Kansai
EPI_ISL_479948Kansai
EPI_ISL_479949Kansai
EPI_ISL_479950Kansai
EPI_ISL_479951Kansai
EPI_ISL_479952Kansai
EPI_ISL_479953Kansai
EPI_ISL_479954Kansai
EPI_ISL_479955Kansai
EPI_ISL_479956Kansai
EPI_ISL_479957Kansai
EPI_ISL_479958Kansai
EPI_ISL_479966Kansai
EPI_ISL_479986Kansai
EPI_ISL_479987Kansai
EPI_ISL_479988Kansai
EPI_ISL_479989Kansai
EPI_ISL_480065Kansai
EPI_ISL_480066Kansai
EPI_ISL_480067Kansai
EPI_ISL_480068Kansai
EPI_ISL_480069Kansai
EPI_ISL_480070Kansai
EPI_ISL_480071Kansai
EPI_ISL_480072Kansai
EPI_ISL_480090Kansai
EPI_ISL_480091Kansai
EPI_ISL_480092Kansai
EPI_ISL_480093Kansai
EPI_ISL_480094Kansai
EPI_ISL_480095Kansai
EPI_ISL_480096Kansai
EPI_ISL_480097Kansai
EPI_ISL_480098Kansai
EPI_ISL_480099Kansai
EPI_ISL_480100Kansai
EPI_ISL_480101Kansai
EPI_ISL_480102Kansai
EPI_ISL_480205Kansai
EPI_ISL_480206Kansai
EPI_ISL_480207Kansai
EPI_ISL_480208Kansai
EPI_ISL_480209Kansai
EPI_ISL_480210Kansai
EPI_ISL_480211Kansai
EPI_ISL_480212Kansai
EPI_ISL_480213Kansai
EPI_ISL_480214Kansai
EPI_ISL_480215Kansai
EPI_ISL_480216Kansai
EPI_ISL_480217Kansai
EPI_ISL_480218Kansai
EPI_ISL_480219Kansai
EPI_ISL_480220Kansai
EPI_ISL_437601Kanto
EPI_ISL_438947Kanto
EPI_ISL_438948Kanto
EPI_ISL_438949Kanto
EPI_ISL_438951Kanto
EPI_ISL_438952Kanto
EPI_ISL_438953Kanto
EPI_ISL_438954Kanto
EPI_ISL_438955Kanto
EPI_ISL_438956Kanto
EPI_ISL_438958Kanto
EPI_ISL_438959Kanto
EPI_ISL_438961Kanto
EPI_ISL_438962Kanto
EPI_ISL_438963Kanto
EPI_ISL_438964Kanto
EPI_ISL_438965Kanto
EPI_ISL_438966Kanto
EPI_ISL_438967Kanto
EPI_ISL_438968Kanto
EPI_ISL_438969Kanto
EPI_ISL_438970Kanto
EPI_ISL_438971Kanto
EPI_ISL_438972Kanto
EPI_ISL_469287Kanto
EPI_ISL_469288Kanto
EPI_ISL_469289Kanto
EPI_ISL_469290Kanto
EPI_ISL_469291Kanto
EPI_ISL_469292Kanto
EPI_ISL_469293Kanto
EPI_ISL_469294Kanto
EPI_ISL_469295Kanto
EPI_ISL_469296Kanto
EPI_ISL_479797Kanto
EPI_ISL_479798Kanto
EPI_ISL_479802Kanto
EPI_ISL_479803Kanto
EPI_ISL_479804Kanto
EPI_ISL_479805Kanto
EPI_ISL_479806Kanto
EPI_ISL_479807Kanto
EPI_ISL_479808Kanto
EPI_ISL_479809Kanto
EPI_ISL_479810Kanto
EPI_ISL_479811Kanto
EPI_ISL_479825Kanto
EPI_ISL_479850Kanto
EPI_ISL_479851Kanto
EPI_ISL_479852Kanto
EPI_ISL_479853Kanto
EPI_ISL_479854Kanto
EPI_ISL_479869Kanto
EPI_ISL_479870Kanto
EPI_ISL_479871Kanto
EPI_ISL_479886Kanto
EPI_ISL_479887Kanto
EPI_ISL_479888Kanto
EPI_ISL_479889Kanto
EPI_ISL_479890Kanto
EPI_ISL_479891Kanto
EPI_ISL_479892Kanto
EPI_ISL_479893Kanto
EPI_ISL_479894Kanto
EPI_ISL_479895Kanto
EPI_ISL_479896Kanto
EPI_ISL_479897Kanto
EPI_ISL_479898Kanto
EPI_ISL_479899Kanto
EPI_ISL_479900Kanto
EPI_ISL_479901Kanto
EPI_ISL_479902Kanto
EPI_ISL_479913Kanto
EPI_ISL_479914Kanto
EPI_ISL_479915Kanto
EPI_ISL_479916Kanto
EPI_ISL_479917Kanto
EPI_ISL_479918Kanto
EPI_ISL_479919Kanto
EPI_ISL_479920Kanto
EPI_ISL_479921Kanto
EPI_ISL_479922Kanto
EPI_ISL_479923Kanto
EPI_ISL_479924Kanto
EPI_ISL_479928Kanto
EPI_ISL_479929Kanto
EPI_ISL_479930Kanto
EPI_ISL_479931Kanto
EPI_ISL_479932Kanto
EPI_ISL_479933Kanto
EPI_ISL_479934Kanto
EPI_ISL_479935Kanto
EPI_ISL_479936Kanto
EPI_ISL_479937Kanto
EPI_ISL_479938Kanto
EPI_ISL_479939Kanto
EPI_ISL_479940Kanto
EPI_ISL_479941Kanto
EPI_ISL_479942Kanto
EPI_ISL_479943Kanto
EPI_ISL_479959Kanto
EPI_ISL_479960Kanto
EPI_ISL_479961Kanto
EPI_ISL_479962Kanto
EPI_ISL_479963Kanto
EPI_ISL_479964Kanto
EPI_ISL_479965Kanto
EPI_ISL_479985Kanto
EPI_ISL_480004Kanto
EPI_ISL_480005Kanto
EPI_ISL_480006Kanto
EPI_ISL_480007Kanto
EPI_ISL_480008Kanto
EPI_ISL_480009Kanto
EPI_ISL_480010Kanto
EPI_ISL_480011Kanto
EPI_ISL_480012Kanto
EPI_ISL_480013Kanto
EPI_ISL_480014Kanto
EPI_ISL_480015Kanto
EPI_ISL_480016Kanto
EPI_ISL_480017Kanto
EPI_ISL_480018Kanto
EPI_ISL_480019Kanto
EPI_ISL_480020Kanto
EPI_ISL_480021Kanto
EPI_ISL_480022Kanto
EPI_ISL_480023Kanto
EPI_ISL_480024Kanto
EPI_ISL_480025Kanto
EPI_ISL_480026Kanto
EPI_ISL_480027Kanto
EPI_ISL_480028Kanto
EPI_ISL_480029Kanto
EPI_ISL_480030Kanto
EPI_ISL_480031Kanto
EPI_ISL_480032Kanto
EPI_ISL_480033Kanto
EPI_ISL_480034Kanto
EPI_ISL_480035Kanto
EPI_ISL_480036Kanto
EPI_ISL_480037Kanto
EPI_ISL_480038Kanto
EPI_ISL_480039Kanto
EPI_ISL_480040Kanto
EPI_ISL_480041Kanto
EPI_ISL_480073Kanto
EPI_ISL_480074Kanto
EPI_ISL_480075Kanto
EPI_ISL_480076Kanto
EPI_ISL_480077Kanto
EPI_ISL_480078Kanto
EPI_ISL_480079Kanto
EPI_ISL_480080Kanto
EPI_ISL_480081Kanto
EPI_ISL_480082Kanto
EPI_ISL_480103Kanto
EPI_ISL_480104Kanto
EPI_ISL_480105Kanto
EPI_ISL_480106Kanto
EPI_ISL_480107Kanto
EPI_ISL_480108Kanto
EPI_ISL_480169Kanto
EPI_ISL_480170Kanto
EPI_ISL_480171Kanto
EPI_ISL_480172Kanto
EPI_ISL_480173Kanto
EPI_ISL_480174Kanto
EPI_ISL_480175Kanto
EPI_ISL_480176Kanto
EPI_ISL_480177Kanto
EPI_ISL_480180Kanto
EPI_ISL_480181Kanto
EPI_ISL_480182Kanto
EPI_ISL_480183Kanto
EPI_ISL_480184Kanto
EPI_ISL_480185Kanto
EPI_ISL_480186Kanto
EPI_ISL_480187Kanto
EPI_ISL_480188Kanto
EPI_ISL_480189Kanto
EPI_ISL_480190Kanto
EPI_ISL_480191Kanto
EPI_ISL_480192Kanto
EPI_ISL_480193Kanto
EPI_ISL_480194Kanto
EPI_ISL_480195Kanto
EPI_ISL_480221Kanto
EPI_ISL_480222Kanto
EPI_ISL_480223Kanto
EPI_ISL_480226Kanto
EPI_ISL_480227Kanto
Japan/P1/2020 EPI_ISL_419296Kochi2020-03-08
Japan/KY-V-029/2020 EPI_ISL_408669Kyoto2020-01-29
EPI_ISL_479824Kyusyu
EPI_ISL_479979Kyusyu
EPI_ISL_479980Kyusyu
EPI_ISL_479981Kyusyu
EPI_ISL_479982Kyusyu
EPI_ISL_479983Kyusyu
EPI_ISL_479984Kyusyu
EPI_ISL_479990Kyusyu
EPI_ISL_479991Kyusyu
EPI_ISL_479992Kyusyu
EPI_ISL_479993Kyusyu
EPI_ISL_479994Kyusyu
EPI_ISL_479995Kyusyu
EPI_ISL_479996Kyusyu
EPI_ISL_480002Kyusyu
EPI_ISL_480003Kyusyu
EPI_ISL_480109Kyusyu
EPI_ISL_480110Kyusyu
EPI_ISL_480111Kyusyu
EPI_ISL_480112Kyusyu
EPI_ISL_480113Kyusyu
EPI_ISL_480114Kyusyu
EPI_ISL_480115Kyusyu
EPI_ISL_480116Kyusyu
EPI_ISL_480117Kyusyu
EPI_ISL_480118Kyusyu
EPI_ISL_480119Kyusyu
EPI_ISL_481251Nagasaki
EPI_ISL_481252Nagasaki
EPI_ISL_481254Nagasaki
EPI_ISL_481255Nagasaki
EPI_ISL_481257Nagasaki
EPI_ISL_481258Nagasaki
EPI_ISL_481259Nagasaki
EPI_ISL_481260Nagasaki
EPI_ISL_481261Nagasaki
EPI_ISL_481263Nagasaki
Japan/NA-20-05-1/2020 EPI_ISL_410531Nara2020-01-25
Japan/OS-20-07-1/2020 EPI_ISL_410532Osaka2020-01-23
Japan/SMU-0311S2/2020 EPI_ISL_416524Saitama2020-03-11
Japan/SMU-0311S3/2020 EPI_ISL_416525Saitama2020-03-11
Japan/P4-1/2020 EPI_ISL_419301Saitama2020-03-11
Japan/P4-2/2020 EPI_ISL_419302Saitama2020-03-12
Japan/P4-3/2020 EPI_ISL_419303Saitama2020-03-12
Japan/P4-4/2020 EPI_ISL_419304Saitama2020-03-17
Japan/P4-5/2020 EPI_ISL_419305Saitama2020-03-18
Japan/P4-6/2020 EPI_ISL_419306Saitama2020-03-20
Japan/P4-7/2020 EPI_ISL_419307Saitama2020-03-20
Japan/P4-8/2020 EPI_ISL_419308Saitama2020-03-19
EPI_ISL_480204Tohoku
Japan/TY-WK-012/2020 EPI_ISL_408665Tokyo2020-01-29
Japan/TY-WK-501/2020 EPI_ISL_408666Tokyo2020-01-31
Japan/TY-WK-521/2020 EPI_ISL_408667Tokyo2020-01-31
Japan/TK-20-31-3/2020 EPI_ISL_413459Tokyo2020-02-20
Japan/UT-NCGM02/2020 EPI_ISL_418809Tokyo2020-02-01
EPI_ISL_462446Tokyo
EPI_ISL_486890Tokyo
EPI_ISL_486891Tokyo
EPI_ISL_486892Tokyo
EPI_ISL_486893Tokyo
EPI_ISL_486894Tokyo
EPI_ISL_486895Tokyo
EPI_ISL_486896Tokyo
EPI_ISL_486897Tokyo
EPI_ISL_486898Tokyo
EPI_ISL_486899Tokyo
EPI_ISL_486900Tokyo
EPI_ISL_486901Tokyo
EPI_ISL_486902Tokyo
EPI_ISL_486903Tokyo
EPI_ISL_486904Tokyo
EPI_ISL_486905Tokyo
EPI_ISL_486906Tokyo
EPI_ISL_486907Tokyo
EPI_ISL_486908Tokyo
EPI_ISL_486909Tokyo
EPI_ISL_486910Tokyo
EPI_ISL_486911Tokyo
EPI_ISL_582135Tokyo
EPI_ISL_582136Tokyo
EPI_ISL_582137Tokyo
EPI_ISL_582138Tokyo
EPI_ISL_582139Tokyo
EPI_ISL_582140Tokyo
EPI_ISL_582141Tokyo
EPI_ISL_582142Tokyo
EPI_ISL_582143Tokyo
EPI_ISL_582144Tokyo
EPI_ISL_582145Tokyo
EPI_ISL_582146Tokyo
EPI_ISL_582147Tokyo

Download all results


GISAID data provided on this website is subject to GISAID’s Terms and Conditions | Privacy policy of University of Turin.